Chiến Tuyến Hải Quan xoay quanh nhân vật Châu Chính Lễ (Tạ Đình Phong), một nhân viên của Hải quan Hồng Kông, người có mối quan hệ thân thiết với cấp trên của mình, Trương Vận Nam (Trương Học Hữu). Trương, dưới áp lực từ cấp trên là Trợ lý Cục trưởng Quách Tử Cường (Ngô Chấn Vũ), đã quyết liệt đề xuất để Lễ tham gia vào một chiến dịch hợp tác giữa Tổ chức Hải quan Thế giới và Tổ chức Cảnh sát Hình sự Quốc tế.