Halo (Phần 2) kể về Master Chief John-117 lãnh đạo đội Sparta tinh nhuệ của mình chống lại mối đe dọa ngoài hành tinh được gọi là Covenant. Sau một sự kiện gây chấn động trên một hành tinh hoang vắng, John không thể lay chuyển được cảm giác rằng cuộc chiến của anh sắp thay đổi và mạo hiểm mọi thứ để chứng minh điều mà không ai khác có thể tin được rằng Hiệp ước đang chuẩn bị tấn công thành trì lớn nhất của nhân loại. Khi thiên hà đang trên bờ vực, John dấn thân vào cuộc hành trình tìm kiếm chìa khóa cứu rỗi loài người hoặc sự tuyệt chủng của loài người: Halo.