Thiếu Niên Không Thấy Bóng lấy bối cảnh những năm 90 của thế kỷ trước, trong một đêm bão táp tại thị trấn nhỏ tên Chiếu Dương, khi một thiếu niên bị truy sát một cách bí ẩn và không rõ sống chết. Cùng lúc đó, hai thiếu niên khác cũng mất tích một cách khó hiểu, dường như bốc hơi khỏi thế gian. Ba năm sau, một trong số họ đột nhiên trở thành tay móc túi nhỏ, giả vờ mất trí nhớ và trở về với gia đình. Nhưng việc nhận thân thành công này liệu là sự tái hợp vui mừng hay là một sai lầm chồng chất?